Начиная с мая 1964 г., на автомобиль устанавливается модернизированный двигатель 407-Д1. [403-1]

Начиная с мая 1964 г., одновременно с установкой на автомобиль модернизированного двигателя 407-Д1 применяется новый распределитель зажигания Р107-Г, у которого в отличие от распределителя Р35 изменена конструкция октан-корректора, а также способ крепления  двигателю. [403-1]

Двигатель модели 407Д является промежуточным переходным двигателем между моделями 407 и 408. Предназначен для установки на автомобиль "Москвич-403" выпуска до апреля 1965 г.
От модели 407 отличается только смещением переходника передней подвески двигателя на 15 мм назад и установки гидравлического привода сцепления. [7]

Двигатель модели 407Д1 также является промежуточным переходным двигателем и предназначался для установки на автомобиль "Москвич-403" выпуска с апреля 1965 г. и кго модификаций 424 и 432. [7]